Чистит. Там настроено это в макродроиде. Именно поэтому после перезагрузки и появляются/исчезают иконки приложений при их установке/удалении
Файловый менеджер не чистит, очистку может делать макрос, который запускает серию действий по переходу в меню и очистки кэша лайнчера, но, с учетом особенностей тайминга виртуальных нажатий на кнопки дисплея, это работает не всегда, надо визуально смотреть, что действия совершены. Это не 100% решение, это помогайка, иногда может и не до конца сработать. Тогда надо помочь руками.
Было бы у нас всё просто, то я бы сделал очистку кэша лайнчера shell командой, но нет доступа, поэтому пока пользуемся тем, что есть.
